私の場合、結局は「データ」および「アプリケーション」の移行を手動で行ないました。しかし、「アプリケーション」の再インストールは、思ったよりも簡単でした。
ほとんどの場合、新しい Mac への移行は、移行アシスタントでTimeMachineから「コンピュータとネットワーク設定」、「データ」および「アプリケーション」の全部を選んで、うまく行くのではないかと思います。
移行後に、もしおかしいところが見つかったときは、解決策を探してみます。すぐに解決しない場合は、OS Xをクリーンインストールし直して、手動で「データ」を移行して、「アプリケーション」の再インストールをする方が早いかもしれません。
特に、プレインストールとApp Storeからのアプリケーションだけを使っている場合、再インストールはとても簡単です。
もし Photoshop Elementsを使っている場合は、念のためにライセンスの解除を行ない、アンインストールしておくことを勧めます。Office for Macについても同様です。
Gmailの、送信メールサーバ (SMTP) がオフラインになる問題は、時間が経つと解消することがあるようなので、しばらく様子をみると良いと思います。
